Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccdc175E9PVB3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccdc175E9PVB3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms