Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cttnbp2B9EJA2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cttnbp2B9EJA2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms