Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cspp1B2RX88 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms