Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AU015836B2RUM3 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AU015836B2RUM3 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms