Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rrn3B2RS91 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rrn3B2RS91 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms