Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf1B2RRD7 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms