Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CK137956B1AYM9 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CK137956B1AYM9 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CK137956B1AYM9 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CK137956B1AYM9 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CK137956B1AYM9 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CK137956B1AYM9 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CK137956B1AYM9 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CK137956B1AYM9 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CK137956B1AYM9 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CK137956B1AYM9 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CK137956B1AYM9 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CK137956B1AYM9 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CK137956B1AYM9 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CK137956B1AYM9 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CK137956B1AYM9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CK137956B1AYM9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CK137956B1AYM9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CK137956B1AYM9 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CK137956B1AYM9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CK137956B1AYM9 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CK137956B1AYM9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CK137956B1AYM9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CK137956B1AYM9 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CK137956B1AYM9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CK137956B1AYM9 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CK137956B1AYM9 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CK137956B1AYM9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CK137956B1AYM9 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CK137956B1AYM9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms