Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Trabd2bB1ATG9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Trabd2bB1ATG9 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Trabd2bB1ATG9 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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