Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spocd1B1ASB6 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms