Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Grik3B1AS29 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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