Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnf39A2RT81 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms