Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms