Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Frmpd1A2AKB4 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Frmpd1A2AKB4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms