Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp8nlA2ABX0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms