Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PtprfA2A8L5 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms