Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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