Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ap3b1Q9Z1T1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ap3b1Q9Z1T1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ap3b1Q9Z1T1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ap3b1Q9Z1T1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ap3b1Q9Z1T1 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ap3b1Q9Z1T1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms