Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Clip2Q9Z0H8 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Clip2Q9Z0H8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Clip2Q9Z0H8 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Clip2Q9Z0H8 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Clip2Q9Z0H8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clip2Q9Z0H8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Clip2Q9Z0H8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Clip2Q9Z0H8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Clip2Q9Z0H8 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Clip2Q9Z0H8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Clip2Q9Z0H8 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Clip2Q9Z0H8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms