Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Rnf4Q9QZS2 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Rnf4Q9QZS2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Rnf4Q9QZS2 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Rnf4Q9QZS2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Rnf4Q9QZS2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Rnf4Q9QZS2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Rnf4Q9QZS2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf4Q9QZS2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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