Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYR6

Map1a, Microtubule-associated protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 2,776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map1aQ9QYR6 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Map1aQ9QYR6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms