Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

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Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpsf3Q9QXK7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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