Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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Trim44Q9QXA7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Trim44Q9QXA7 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim44Q9QXA7 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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