Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tcea2Q9QVN7 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tcea2Q9QVN7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tcea2Q9QVN7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tcea2Q9QVN7 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tcea2Q9QVN7 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tcea2Q9QVN7 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tcea2Q9QVN7 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tcea2Q9QVN7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tcea2Q9QVN7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tcea2Q9QVN7 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tcea2Q9QVN7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcea2Q9QVN7 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms