Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Dkk3Q9QUN9 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Dkk3Q9QUN9 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Dkk3Q9QUN9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Dkk3Q9QUN9 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Dkk3Q9QUN9 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Dkk3Q9QUN9 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dkk3Q9QUN9 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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