Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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