Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdc42ep4Q9JM96 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdc42ep4Q9JM96 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms