Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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