Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms