Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gde1Q9JL56 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms