Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Habp4Q9JKS5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Habp4Q9JKS5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Habp4Q9JKS5 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Habp4Q9JKS5 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Habp4Q9JKS5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Habp4Q9JKS5 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Habp4Q9JKS5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Habp4Q9JKS5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Habp4Q9JKS5 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms