Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmbr1Q9JIT0 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms