Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ush1cQ9ES64 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms