Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Usp29Q9ES63 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Usp29Q9ES63 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Usp29Q9ES63 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Usp29Q9ES63 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Usp29Q9ES63 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Usp29Q9ES63 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Usp29Q9ES63 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp29Q9ES63 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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