Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH4

Taf8, Transcription initiation factor TFIID subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf8Q9EQH4 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf8Q9EQH4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms