Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SgshQ9EQ08 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 231.6 ms