Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT6

Bap18, Chromatin complexes subunit BAP18, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap18Q9DCT6 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Bap18Q9DCT6 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Bap18Q9DCT6 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Bap18Q9DCT6 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Bap18Q9DCT6 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Bap18Q9DCT6 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Bap18Q9DCT6 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Bap18Q9DCT6 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Bap18Q9DCT6 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Bap18Q9DCT6 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Bap18Q9DCT6 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Bap18Q9DCT6 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Bap18Q9DCT6 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Bap18Q9DCT6 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Bap18Q9DCT6 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Bap18Q9DCT6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Bap18Q9DCT6 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Bap18Q9DCT6 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Bap18Q9DCT6 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Bap18Q9DCT6 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Bap18Q9DCT6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Bap18Q9DCT6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Bap18Q9DCT6 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Bap18Q9DCT6 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Bap18Q9DCT6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Bap18Q9DCT6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Bap18Q9DCT6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Bap18Q9DCT6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Bap18Q9DCT6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Bap18Q9DCT6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Bap18Q9DCT6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Bap18Q9DCT6 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bap18Q9DCT6 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms