Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn3Q9DCB1 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn3Q9DCB1 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn3Q9DCB1 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn3Q9DCB1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn3Q9DCB1 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn3Q9DCB1 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn3Q9DCB1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn3Q9DCB1 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn3Q9DCB1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn3Q9DCB1 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn3Q9DCB1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn3Q9DCB1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn3Q9DCB1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn3Q9DCB1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn3Q9DCB1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn3Q9DCB1 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn3Q9DCB1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn3Q9DCB1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn3Q9DCB1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn3Q9DCB1 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn3Q9DCB1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn3Q9DCB1 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn3Q9DCB1 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn3Q9DCB1 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn3Q9DCB1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn3Q9DCB1 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn3Q9DCB1 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn3Q9DCB1 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn3Q9DCB1 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hmgn3Q9DCB1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Hmgn3Q9DCB1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Hmgn3Q9DCB1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Hmgn3Q9DCB1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hmgn3Q9DCB1 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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