Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rnf6Q9DBU5 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rnf6Q9DBU5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rnf6Q9DBU5 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rnf6Q9DBU5 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rnf6Q9DBU5 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rnf6Q9DBU5 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rnf6Q9DBU5 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf6Q9DBU5 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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