Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrpraQ9DBG7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms