Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms