Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Subh2bvQ9D9Z7 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Subh2bvQ9D9Z7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Subh2bvQ9D9Z7 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Subh2bvQ9D9Z7 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Subh2bvQ9D9Z7 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Subh2bvQ9D9Z7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Subh2bvQ9D9Z7 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Subh2bvQ9D9Z7 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Subh2bvQ9D9Z7 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Subh2bvQ9D9Z7 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Subh2bvQ9D9Z7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Subh2bvQ9D9Z7 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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