Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gtf3c6Q9D8P7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gtf3c6Q9D8P7 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gtf3c6Q9D8P7 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Gtf3c6Q9D8P7 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Gtf3c6Q9D8P7 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Gtf3c6Q9D8P7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Gtf3c6Q9D8P7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Gtf3c6Q9D8P7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Gtf3c6Q9D8P7 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Gtf3c6Q9D8P7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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