Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Derl3Q9D8K3 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Derl3Q9D8K3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms