Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cldn22Q9D7U6 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn22Q9D7U6 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
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