Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm3404Q9D506 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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