Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc105Q9D4K7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms