Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms