Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

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Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Snx29Q9D3S3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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Snx29Q9D3S3 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Snx29Q9D3S3 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Snx29Q9D3S3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx29Q9D3S3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms