Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms