Protein–RNA interactions for Protein: Q9D350

Obox1, OBOX1, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox1Q9D350 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Obox1Q9D350 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms